Institutionen erbjuder ett treårigt kandidatprogram i geovetenskap (180 hp), samt ett Civilingenjörsprogram i miljö- och vattenteknik (300 hp) som ges i samarbete med Sveriges lantbruksuniversitet (SLU). Institutionen är även ansvarig för inriktningen Meteorologi på kandidatprogrammet i fysik (180 hp).
Institutionen erbjuder ett Masterprogram i Geovetenskap (120 hp) med fyra olika inriktningar: Paleobiologi, Geologi, Hydrologi och Naturgeografi. I samarbete med institutionen för fysik och astronomi erbjuds dessutom två inriktningar inom Masterprogrammet i fysik (120 hp); Meteorologi och Geofysik. I samarbete med SLU erbjuds ett Masterprogram i hållbar utveckling (120 hp).
Doktorander antas till alla forskningsprogram.
Institutionen är organiserad i fem större forskningsprogram: Geofysik, Berggrundsgeologi, Paleobiologi, Luft- vatten- och landskapslära (LUVAL) samt Globala energisystem.
Inom och mellan dessa fem program arbetar ett flertal forskargrupper:
LUVAL, institutionens största program, består av fem forskargrupper: Vatten, Klimat&Miljö, Is&Klimat, Luft-vatten utbyte, Vindenergi och Geohydrologi.
Berggrundsgeologi består av två forskargrupper: Tektonik och geodynamik samt Mineralogi och petrologi
Paleobiologi består av två forskargrupper: Paleobiologi och fylogenin hos metazoa samt Mikropaleontologi.
Geofysik består av två forskargrupper: Seismologi och geodynamiska modeller samt Tillämpad geofysik.
Globala energisystem består av en forskargrupp med samma namn.
Institutionens forskning fokuseras och presenteras genom dess fyra fokusområden: energi, naturresurser, naturkatastrofer samt livets utveckling.
Institutionen är ansvarig för ett flertal nationella och internationella grupper och samarbeten. Framför allt CNDS (Centrum för naturkatastroflära) och SNSN (Svenska Nationella Seismiska Nätet).